黃寺位于安定門外黃寺大街。有東黃寺和西黃寺，故稱雙黃寺。東黃寺又名普凈禪林，建于清順治八年(1651)，是為治佛腦木汗所建，西黃寺建于順治九年(1652)，達賴喇嘛五世在當年12月來京時住此。順治十年(1653)，達賴刺嘛辭歸。乾隆四十五年(1780)，班禪額爾德尼六世來京，清高宗指定把五世達賴曾經住過的西黃寺作為他的安禪之所。